Marcio, acredito que o procedimento correto seja você emitir uma nota de entrada no seu CNPJ, informando você mesmo.

É uma nota de você pessoa física para você pessoa jurídica. Esse procedimento está descrito no item 1 desse link do Sebrae:

https://www.sebrae.com.br/sites/portalsebrae/artigos/como-o-mei-deve-proceder-com-nota-fiscal-impostos-e-importacao,fc1a13074c0a3410vgnvcm1000003b74010arcrd

O que se entende é que como a nota fiscal é emitida pela fabricante ou comerciante em nome de pessoas físicas, o MEI e revendedor como Pessoa Jurídica, deve emitir uma Nota Fiscal de Entrada destes produtos, em sua própria Nota Fiscal, visando acobertar a operação fiscal, ingressando com esta mercadoria em seu estoque para posterior revenda. Observe também o que prevê a legislação tributária de seu Estado.

De qualquer forma, atenção nas próximas compras, o melhor é sempre emitir a compra no CNPJ.