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As funções são:

• Vigilância agropecuária do trânsito interestadual de vegetais e animais.
• Coordenação e execução de programas e campanhas de controle e erradicação de pragas dos vegetais e doenças dos animais.
• Manutenção dos informes nos gráficos.
• Coordenação e execução das ações de epidemiologia.
• Coordenação e execução dos programas, dos projetos e das atividades de educação sanitária em sua área de atuação.
• Controle da rede de diagnóstico e dos profissionais de sanidade credenciados.
• Coordenação e compilação das informações referentes às atividades de sanidade agropecuária.
• Auditagem e outras atividades em relação às instâncias locais.

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