Olá Adriana,

A guia do MEI foi gerada no próprio Portal do Empreendedor ou por aplicativo? Verificou no histórico do seu aplicativo se o status do PIX está como concluído, bem como se os dados da guia conferem com os do pagamento? Caso já tenha conferido essas informações tente utilizar o canal Simples Nacional (fazenda.gov.br).

Atenciosamente