Bom dia!

Imagine a seguinte situação: os fiscais da fazenda fazem uma análise da movimentação financeira de um determinado CNPJ e observam que há somente vendas e receitas, mas não são registrados os custos relativos à compras de mercadorias para a venda aos clientes. Provavelmente iriam revirar a contabilidade da empresa de cabeça para baixo e as multas seriam bem pesadas.  Sugiro que veja a situação reportada por você com um profissional da contabilidade, pois essa pessoa poderá lhe passar orientações de como proceder.

Quanto aos CNAEs, acesse ao link abaixo e veja as informações sobre o assunto:

http://www.portaldoempreendedor.gov.br/temas/quero-ser/formalize-se/atividades-permitidas